Package index
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AbstractAnnData
- Abstract AnnData class
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AnnData-usage
- AnnData structure and usage
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AnnData()
- Create an in-memory AnnData object.
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HDF5AnnData
- HDF5AnnData
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InMemoryAnnData
- InMemoryAnnData
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as_AnnData()
- Convert to an
AnnData
object
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from_Seurat()
deprecated - Convert a Seurat object to an AnnData object
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from_SingleCellExperiment()
deprecated - Convert a SingleCellExperiment object to an AnnData object
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generate_dataset()
- Generate a dataset
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read_h5ad()
- Read H5AD
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to_Seurat()
deprecated - Convert an AnnData object to a Seurat object
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to_SingleCellExperiment()
deprecated - Convert an AnnData object to a SingleCellExperiment object
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write_h5ad()
- Write H5AD