Package index • anndataR

All functions

AbstractAnnData: Abstract AnnData class

AnnData-usage: AnnData structure and usage

AnnData(): Create an in-memory AnnData object.

HDF5AnnData: HDF5AnnData

InMemoryAnnData: InMemoryAnnData

as_AnnData(): Convert to an AnnData object

as_HDF5AnnData: Convert an AnnData to an HDF5AnnData

as_InMemoryAnnData: Convert an AnnData to an InMemoryAnnData

as_Seurat: Convert an AnnData to a Seurat

as_SingleCellExperiment: Convert an AnnData to a SingleCellExperiment

generate_dataset(): Generate a dataset

read_h5ad(): Read H5AD

write_h5ad(): Write H5AD